이것이 사실이라 해도 당초 주장했던 만큼 진화의 점진적인 설명을 부정하는 것은 아니라는 반론도 나오고 있다. 마이어가 주장한 이소적 종의 형성설에 대한 지질학적 증거로서 자리를 잡았다는 점도 유의할 필요가 있다. 표현형분류와 계통분류는 경우에 따라 일치하나 두드러진 형태상의 차이가 비교적 단기간에 생긴 경우에는 달라질 가능성이 있다. 뚜렷한 분기가 생기거나, 또한 종의 급격한 분기가 생긴 뒤 오랜 정체기가 있다고 하는 단속평형설(斷續平衡設;구분평형설)을 고생물학자 N. 다만 중립설 그 자체는 표현형의 적응에 대한 설명을 하고 있지 못하며, 진화에 대해 풍부한 지식을 가져다 줄 것임에 틀림이 없다. 이 입장이 추론에 근거한 계통적 유연관계를 인정하지 않는다고 주장하는 데 대하여 ......
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9. 진화를 둘러싼 현대의 문제
분자 레벨에서의 유전메커니즘 해명이 진척된 까닭으로 분자 레벨에서의 진화는 DNA상의 염기배열의 변화 및 치환으로 이해됨과 동시에 진화에서 유성생식의 의의가 중요하다는 것을 한층 깊이 인식하게 되었으며, 중립적인 돌연변이의 사실도 이해하게 되어 적응만능론에 일부 학자들에 의한 중립설도 덧붙여지게 되었다.
이 중립돌연변이를 이용한 분자시계가 계통분기의 추정에 유효하다는 것도 인정되고 있다. 다만 중립설 그 자체는 표현형의 적응에 대한 설명을 하고 있지 못하며, 유전적 변이의 풍부화 가능성을 제시할 따름이다. 중립설에 의거함으로써 진화의 우연성만이 강조되는 일도 있으나, 그것은 적응만능론에 대한 경고의 의의는 있을지라도 적응의 설명과는 또 다른 문제이다. 진핵(眞核) 생물에서는 유전자의 중복구조와 움직이는 유전자(transposon)의 존재가 확인되어 분자유전학은 이제 새로운 전기를 맞고 있으며, 진화에 대해 풍부한 지식을 가져다 줄 것임에 틀림이 없다. 또 계통분류학의 방법을 둘러싸고 세 학파의 논쟁이 현재도 계속되고 있다. 그 하나는 임의로 선택한 형질에 의한 분류를 주관적이라고 배척하고 수량분류의 입장에서 가능한 한 많은 형질을 양적으로 다루고 유사도를 지표로 하여 그룹나누기를 하는 표현형분류학(表現型分類學)의 학파이다.
이 입장이 추론에 근거한 계통적 유연관계를 인정하지 않는다고 주장하는 데 대하여 W. 헤니히 등이 제창한 계통분류는 단(單)계통에 근거한 분류를 주장하고 있다. 결국 상동형질에 대하여 그 형질상태로부터 가장 새롭게 형성된 파생형질(자손형질)을 찾아낼 수 있다면 그것을 공유하는 군을 단계통의 가지(클레이드)로 삼을 수 있다. 그것을 반복하여 보다 고차원적인 계통분류가 가능해진다(클라디스틱스). 또 계통군 진화과정에서의 분화 정도의 차이가 있는 것을 중시하여 분류하는 입장도 있어 진화적 분류학이라고 한다.
표현형분류와 계통분류는 경우에 따라 일치하나 두드러진 형태상의 차이가 비교적 단기간에 생긴 경우에는 달라질 가능성이 있다. 뚜렷한 분기가 생기거나, 수렴(收斂)을 일으키면 계통군과 표현형간에 차이가 나타난다. 여러 가지 이론이 있으나 표현형분류는 근연인 그룹에 있어서 그런 대로 유효하지만 여러 형질을 어떻게 측정하며 차이의 거리를 어떻게 계산하느냐 하는 문제가 남으며 계통분류는 파생적 형질의 구명(究明)이 반드시 간단하지만은 않다는 등의 비판도 있다. 그러나 종전의 분류 방법의 결함도 또한 확실하므로 여러 가지 절충이 시도되고 있다.
대진화에 대하여 점진적인 변화로는 설명하기 어려운 현상이 화석 기록에 의해서 나타나고, 또한 종의 급격한 분기가 생긴 뒤 오랜 정체기가 있다고 하는 단속평형설(斷續平衡設;구분평형설)을 고생물학자 N. 앨드리지와 S.J. 굴드가 1972년 제출하여 큰 논쟁을 불러일으켰다. 다만 지질학적 시간척도에서 말하는 급격한 변화는 유전학적 시간척도로는 상당히 장기간에 걸쳐 일어나는 것이므로, 이것이 사실이라 해도 당초 주장했던 만큼 진화의 점진적인 설명을 부정하는 것은 아니라는 반론도 나오고 있다. 그보다도 장기간의 정체가 왜 생기느냐 하는 것이 점진설에서의 문제일지도 모른다. 종의 형성(분화)이 일어나는 방식에 대해서는 주변의 작은 개체군에서의 새로운 변이의 정착을 가정하고 있어 E. 마이어가 주장한 이소적 종의 형성설에 대한 지질학적 증거로서 자리를 잡았다는 점도 유의할 필요가 있다. 종의 형성 메커니즘에 대해서는 종합설이 시작되었던 당시 가능성이 낮다고 여겨졌던, 동소적 종의 형성도 임의 추측에 의한 교배가 아닌 동일계통적 교배가 일어난다면 종래 생각한 이상으로 일어날 가능성이 높은 것으로 여겨지고 있다.
종의 형성의 기본 과정은 단지 외적인 요인에 의한 격리만으로는 설명할 수 없는 현상인 것도 확실한 듯하다. 어떻게 해서 종이 분화하였는가 하는 문제는 진화과정을 이해하는 데 불가피한 논점임에 틀림이 없으나 유전자의 상호교환·중립적인 것을 포함한 돌연변이·유전적 부동(浮動)·유전자중복 등 여러 가지 변이가
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